Официальный источник, близкий к правительству Палестинской автономии, заявил, что Израиль "сделал большую ошибку", не уничтожив в ходе военной операции власть ХАМАСа в Газе. Такой исход событий был бы лучшим для Абу-Мазена, призывы которого к единству палестинских сил не только не находят позитивного отклика, но положение, напротив, только дестабилизируется. Официально Ольмерт никогда не объявлял уничтожение ХАМАСа целью военной операции, но многие полагали, что премьер-министр просто перестраховывается, и Абу-Мазен ориентировался на высказывания некоторых израильских министров о необходимости свержение власти ХАМАСа.
ФАТХ опасается усиления позиций ХАМАса в Иудее и Самарии, преследует противников на контролируемой Абу-Мазеном территории, и уже арестовано более 30-ти человек. ХАМАС после окончания военных действий сводит счеты с членами ФАТХ в Газе, обвиняя их в пособничестве Израилю.