Несогласованность действий российского МИДа и служб аэропорта привела к тому, что отлет Шимона Переса из Москвы сопровождался проволочками и унизительными для президента процедурами проверки. Пограничная служба объявила, что будет проверять паспорта президента и его свиты только в их присутствии, что противоречит общепринятым нормам. Пересу не разрешили подъехать к самолету на автомобиле, так что он вынужден был добираться пешком по терминалу, как все обычные пассажиры. Почетный эскорт ему отказались предоставить, а в самолете в ожидании взлета президенту пришлось прождать больше часа.
Лишь вмешательство представителей израильского посольства в Москве убедило местные власти предоставить президенту машину и разрешить дипломатам его сопровождать к трапу. Канцелярия президента решила не раздувать скандал, и оттуда сообщили, что ждать взлета пришлось только полчаса и никаких претензий у Переса нет.